手动组织芯片点样仪主要包括操作平台、打孔取样装置和一个定位控制器，打孔取样装置可对供体组织蜡块进行采样，也可对受体组织蜡块进行打孔，打孔针外径与取样针内孔径相同，两者均可通过旋转定位控制器顶端的旋钮来精确定位。
定位控制器可是打孔取样针前后左右线性移动，其微型显示器可实时显示针的相对位置或者绝对位置，从而可以制备出孔径、孔距、孔深*相同的组织芯片蜡块。通过切片辅助系统将其转移并固定到硅化和胶化玻片上即成为组织芯片。
手动组织芯片点样仪的特点：
1、步进电机控制，点样较为准确；
2、点样条带窄，提高分离度，特别适于薄层扫描定量；
3、全电脑控制，高度自动化，方法可任意设置，储存；
4、点样状态实时显示，可重复点样，可随时调节点样速度；
5、优势在于条带点样，条带点样比圆点点样分离的组分更多，分离度更好，前提是要条带点的要足够细，如果条带点样宽度与圆点接触点样样点还宽，就失去条带点样的意义。
手动组织芯片点样仪通过简单的操作将几百件组织样本进行精确的微阵列，以实现单个石蜡块包含数以百计的组织样本，大大提高生物学信息通量，并有效防止了系统实验误差，这在分子诊断/预后指标筛选/治疗靶点定位/抗体和药物筛选/基因和蛋白表达分析等领域意义重大。
